| Автор | Hesse, Anne-Marie |
| Автор | Vinh, Joëlle |
| Дата выпуска | 2010 |
| ISBN | 978-1-84755-911-1 |
| dc.description | Understanding the functioning of a living cell supposes to decipher the complex molecular mechanisms which underlie the various cellular activities. All the genes of an organism, or its genome, constitute a static and specific databank of this living being. From a unique genome, every cellular type of an organism is going to express a set of proteins, or proteome, which is going to vary according to the environment of the cells. As proteins constitute the final actors of the biological processes, their study may offer the most relevant vision of the functioning of a living cell.In this part the specificity of proteomic approaches are discussed. Analytical strategies involving biological mass spectrometry are presented in association with liquid chromatography. Multidimensional analyses are introduced for complex mixture analysis and quantification. In conclusion specific technological developments towards the miniaturization, the integration and the automation of the analysis of samples available in very low amounts are introduced as the next step towards single cell proteomics. |
| Формат | application.pdf |
| Издатель | Royal Society of Chemistry |
| Название | Chapter 10. Proteomics |
| Тип | other |
| DOI | 10.1039/9781849732284-00093 |
| Print ISSN | 1757-7136 |
| Журнал | Unravelling Single Cell Genomics |
| Первая страница | 93 |
| Последняя страница | 110 |
| Библиографическая ссылка | N. L. Anderson, N. G. Anderson, Electrophoresis, 1998, 19, 11, 1853, 1861 |
| Библиографическая ссылка | D. N. Perkins, et al., Electrophoresis, 1999, 20, 18, 3551, 3567 |
| Библиографическая ссылка | E. Audinat, B. Lambolez, J. Rossier, Neurochem. Int., 1996, 28, 2, 119, 136 |
| Библиографическая ссылка | P. A. Haynes, N. Fripp, R. Aebersold, Electrophoresis, 1998, 19, 6, 939, 945 |
| Библиографическая ссылка | S. A. Hofstadler, et al., Anal. Chem., 1995, 67, 8, 1477, 1480 |
| Библиографическая ссылка | L. Li, et al., Anal. Chem., 2000, 72, 16, 3867, 3874 |
| Библиографическая ссылка | V. Redeker, et al., Anal. Chem., 1998, 70, 9, 1805, 1811 |
| Библиографическая ссылка | D. G. Grier, Nature, 2003, 424, 6950, 810, 816 |
| Библиографическая ссылка | M. Castelain, et al., J. Chem. Phys., 2007, 127, 13, 135104 |
| Библиографическая ссылка | G. D. Wright, et al., Fungal Genet. Biol., 2007, 44, 1, 1, 13 |
| Библиографическая ссылка | I. Safarik, M. Safarikova, J. Chromatogr. B: Biomed. Sci. Appl., 1999, 722, 1â 2, 33, 53 |
| Библиографическая ссылка | J. An, et al., et al., Anal. Bioanal. Chem., 2009, 394, 801, 809 |
| Библиографическая ссылка | X. Hu, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2005, 102, 44, 15757, 15761 |
| Библиографическая ссылка | M. B. Dainiak, et al., Adv. Biochem. Eng. Biotechnol., 2007, 106, 1, 18 |
| Библиографическая ссылка | H. B. Gutstein, et al., Mass Spectrom. Rev., 2008, 27, 4, 316, 330 |
| Библиографическая ссылка | B. Herbert, E. Harry, Methods Mol. Biol., 2009, 519, 47, 63 |
| Библиографическая ссылка | B. A. Stanley, et al., Dis Markers, 2004, 20, 3, 167, 178 |
| Библиографическая ссылка | J. M. Robinson, D. D. Vandre, W. E. T. Ackerman, Placenta, 2009, 30, Suppl A, S83, S89 |
| Библиографическая ссылка | E. C. Schirmer, L. Gerace, Trends Biochem. Sci., 2005, 30, 10, 551, 558 |
| Библиографическая ссылка | M. Bantscheff, et al., Ernst Schering Found Symp. Proc., 2007, 3, 1, 28 |
| Библиографическая ссылка | A. Amoresano, et al., Methods Mol. Biol., 2009, 527, 173, 190 |
| Библиографическая ссылка | S. Beranova-Giorgianni, D. M. Desiderio, F. Giorgianni, Methods Mol. Biol., 2009, 519, 383, 396 |
| Библиографическая ссылка | B. Domon, et al., et al., J. Proteome Res., 2009, 8, 2633, 2639 |
| Библиографическая ссылка | M. L. Miller, N. Blom, Methods Mol. Biol., 2009, 527, 299, 310 |
| Библиографическая ссылка | A. Nita-Lazar, H. Saito-Benz, F. M. White, Proteomics, 2008, 8, 21, 4433, 4443 |
| Библиографическая ссылка | G. Pocsfalvi, Methods Enzymol., 2009, 457, 81, 96 |
| Библиографическая ссылка | C. R. Jimenez, et al., J. Neurochem., 1994, 62, 1, 404, 407 |
| Библиографическая ссылка | R. W. Garden, et al., J. Mass Spectrom., 1996, 31, 10, 1126, 1130 |
| Библиографическая ссылка | S. S. Rubakhin, J. V. Sweedler, Anal. Chem., 2008, 80, 18, 7128, 7136 |
| Библиографическая ссылка | S. S. Rubakhin, J. V. Sweedler, Nat. Protoc., 2007, 2, 8, 1987, 1997 |
| Библиографическая ссылка | S. Neupert, et al., Anal. Chem., 2007, 79, 10, 3690, 3694 |
| Библиографическая ссылка | L. Li, R. W. Garden, J. V. Sweedler, Trends Biotechnol., 2000, 18, 4, 151, 160 |
| Библиографическая ссылка | C. M. Whitehouse, et al., Anal. Chem., 1985, 57, 3, 675, 679 |
| Библиографическая ссылка | J. B. Fenn, et al., Science, 1989, 246, 4926, 64, 71 |
| Библиографическая ссылка | M. Wilm, M. Mann, Anal. Chem., 1996, 68, 1, 1, 8 |
| Библиографическая ссылка | Z. Takats, et al., Science, 2004, 306, 5695, 471, 473 |
| Библиографическая ссылка | M. Karas, F. Hillenkamp, Anal. Chem., 1988, 60, 20, 2299, 2301 |
| Библиографическая ссылка | E. Nordhoff, H. Lehrach, J. Gobom, Int. J. Mass Spect., 2007, 268, 2â 3, 139, 146 |
| Библиографическая ссылка | J. C. Lee, et al., Angew Chem. Int. Ed. Engl., 2006, 45, 17, 2753, 2757 |
| Библиографическая ссылка | N. Y. Hsu, et al., Anal. Chem., 2008, 80, 13, 5203, 5210 |
| Библиографическая ссылка | M. L. Reyzer, R. M. Caprioli, Curr. Opin. Chem. Biol., 2007, 11, 1, 29, 35 |
| Библиографическая ссылка | S. M. Batoy, et al., Lipids, 2009, 44, 4, 367, 371 |
| Библиографическая ссылка | M. A. Baldwin, Methods Enzymol., 2005, 402, 3, 48 |
| Библиографическая ссылка | B. Domon, R. Aebersold, Science, 2006, 312, 5771, 212, 217 |
| Библиографическая ссылка | N. L. Anderson, N. G. Anderson, Mol. Cell. Proteomics, 2002, 1, 11, 845, 867 |
| Библиографическая ссылка | M. P. Washburn, D. Wolters, J. R. Yates 3rd, Nat. Biotechnol., 2001, 19, 3, 242, 247 |
| Библиографическая ссылка | D. A. Wolters, M. P. Washburn, J. R. Yates 3rd, Anal. Chem., 2001, 73, 23, 5683, 5690 |
| Библиографическая ссылка | R. Zubarev, M. Mann, Mol. Cell Proteomics, 2007, 6, 3, 377, 381 |
| Библиографическая ссылка | K. R. Clauser, P. Baker, A. L. Burlingame, Anal. Chem., 1999, 71, 14, 2871, 2882 |
| Библиографическая ссылка | T. P. Conrads, et al., Anal. Chem., 2000, 72, 14, 3349, 3354 |
| Библиографическая ссылка | L. Sleno, D. A. Volmer, A. G. Marshall, J. Am. Soc. Mass Spectrom., 2005, 16, 2, 183, 198 |
| Библиографическая ссылка | E. J. Takach, et al., J. Protein Chem., 1997, 16, 5, 363, 369 |
| Библиографическая ссылка | R. A. Zubarev, P. Hakansson, B. Sundqvist, Anal. Chem., 1996, 68, 22, 4060, 4063 |
| Библиографическая ссылка | M. B. Comisarow, A. G. Marshall, J. Chem. Phys., 1976, 64, 1, 110, 119 |
| Библиографическая ссылка | J. Dawson, M. Guilhaus, Rapid Commun. Mass Spectrom., 1989, 3, 5, 155, 159 |
| Библиографическая ссылка | A. Makarov, Anal. Chem., 2000, 72, 6, 1156, 1162 |
| Библиографическая ссылка | S. A. Beausoleil, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2004, 101, 33, 12130, 12135 |
| Библиографическая ссылка | J. V. Olsen, M. Mann, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2004, 101, 37, 13417, 13422 |
| Библиографическая ссылка | M. L. Nielsen, M. M. Savitski, R. A. Zubarev, Mol. Cell Proteomics, 2005, 4, 6, 835, 845 |
| Библиографическая ссылка | W. Haas, et al., Mol. Cell Proteomics, 2006, 5, 7, 1326, 1337 |
| Библиографическая ссылка | F. He, et al., J. Proteome Res., 2004, 3, 1, 61, 67 |
| Библиографическая ссылка | R. D. Smith, et al., Proteomics, 2002, 2, 5, 513, 523 |
| Библиографическая ссылка | W. M. Bodnar, et al., J. Am. Soc. Mass Spectrom., 2003, 14, 9, 971, 979 |
| Библиографическая ссылка | M. Gilar, et al., J. Chromatogr. A, 2004, 1061, 2, 183, 192 |
| Библиографическая ссылка | G. Guiochon, J. Chromatogr. A, 2006, 1126, 1â 2, 6, 49 |
| Библиографическая ссылка | J. C. Giddings, Anal. Chem., 1984, 56, 12, 1258A, 1260A, 1262A, 1264A, passim |
| Библиографическая ссылка | G. Guiochon, et al., J. Chromatog., 1983, 255, January, 415, 437 |
| Библиографическая ссылка | H. Stutz, Electrophoresis, 2005, 26, 7â 8, 1254, 1290 |
| Библиографическая ссылка | J. Ding, P. Vouros, Anal. Chem., 1999, 71, 11, 378A, 385A |
| Библиографическая ссылка | F. Hsieh, et al., Rapid Commun. Mass Spectrom., 1999, 13, 1, 67, 72 |
| Библиографическая ссылка | S. Wittke, et al., J. Chromatogr. A, 2003, 1013, 1â 2, 173, 181 |
| Библиографическая ссылка | N. A. Guzman, J. Chromatogr. B: Biomed. Sci. Appl., 2000, 749, 2, 197, 213 |
| Библиографическая ссылка | E. Barcelo-Barrachina, E. Moyano, M. T. Galceran, Electrophoresis, 2004, 25, 13, 1927, 1948 |
| Библиографическая ссылка | P. K. Jensen, et al., Electrophoresis, 2000, 21, 7, 1372, 1380 |
| Библиографическая ссылка | J. S. Page, S. S. Rubakhin, J. V. Sweedler, Anal. Chem., 2002, 74, 3, 497, 503 |
| Библиографическая ссылка | N. L. Anderson, et al., Mol. Cell Proteomics, 2009, 8, 5, 883, 886 |
| Библиографическая ссылка | K. G. Kline, et al., J. Proteome Res., 2008, 7, 11, 5055, 5061 |
| Библиографическая ссылка | V. Lange, et al., Mol. Syst. Biol., 2008, 4, 222 |
| Библиографическая ссылка | A. Panchaud, et al., J. Proteomics, 2008, 71, 1, 19, 33 |
| Библиографическая ссылка | S. Pan, et al., J. Proteome Res., 2009, 8, 2, 787, 797 |
| Библиографическая ссылка | A. Schmidt, M. Karas, T. Dulcks, J. Am. Soc. Mass Spectrom., 2003, 14, 5, 492, 500 |
| Библиографическая ссылка | A. Dodge, et al., Analyst, 2006, 131, 10, 1122, 1128 |
| Библиографическая ссылка | A. G. Hadd, et al., Anal. Chem., 1997, 69, 17, 3407, 3412 |
| Библиографическая ссылка | J. Lee, S. A. Soper, K. K. Murray, J. Mass Spectrom., 2009, 44, 5, 579, 593 |
| Библиографическая ссылка | W. C. Sung, H. Makamba, S. H. Chen, Electrophoresis, 2005, 26, 9, 1783, 1791 |
| Библиографическая ссылка | R. S. Ramsey, J. M. Ramsey, Anal. Chem., 1997, 69, 6, 1174, 1178 |
| Библиографическая ссылка | Q. Xue, et al., Anal. Chem, 1997, 69, 3, 426, 430 |
| Библиографическая ссылка | J. Wen, et al., Electrophoresis, 2000, 21, 1, 191, 197 |
| Библиографическая ссылка | D. Figeys, Y. Ning, R. Aebersold, Anal. Chem., 1997, 69, 16, 3153, 3160 |
| Библиографическая ссылка | H. Yin, et al., Anal. Chem., 2005, 77, 2, 527, 533 |
| Библиографическая ссылка | H. Yin, K. Killeen, J. Sep. Sci., 2007, 30, 10, 1427, 1434 |
| Библиографическая ссылка | M. H. Fortier, et al., Anal. Chem., 2005, 77, 6, 1631, 1640 |
| Библиографическая ссылка | M. Vollmer, et al., J. Sep. Sci., 2006, 29, 4, 499, 509 |
| Библиографическая ссылка | G. A. Schultz, et al., Anal. Chem., 2000, 72, 17, 4058, 4063 |
| Библиографическая ссылка | S. Zhang, C. K. Van Pelt, J. D. Henion, Electrophoresis, 2003, 24, 21, 3620, 3632 |
| Библиографическая ссылка | J. M. Dethy, et al., Anal. Chem., 2003, 75, 4, 805, 811 |
| Библиографическая ссылка | D. L. DeVoe, C. S. Lee, Electrophoresis, 2006, 27, 18, 3559, 3568 |
| Библиографическая ссылка | J. Liu, et al., Anal. Chem., 2001, 73, 9, 2147, 2151 |
| Библиографическая ссылка | S. Hsieh, et al., Anal. Chem., 1998, 70, 9, 1847, 1852 |
| Библиографическая ссылка | T. Miliotis, et al., J. Mass Spectrom., 2000, 35, 3, 369, 377 |
| Библиографическая ссылка | A. Walch, et al., Histochem. Cell Biol., 2008, 130, 3, 421, 434 |
| Библиографическая ссылка | I. Fournier, M. Wisztorski, M. Salzet, Expert Rev. Proteomics, 2008, 5, 3, 413, 424 |
| Библиографическая ссылка | M. Wisztorski, et al., Dev. Neurobiol., 2008, 68, 6, 845, 858 |
| Библиографическая ссылка | W. M. Hardesty, R. M. Caprioli, Anal. Bioanal. Chem., 2008, 391, 3, 899, 903 |
