| Автор | Marcy, Yann |
| Автор | Bras, Angélique Le |
| Дата выпуска | 2010 |
| ISBN | 978-1-84755-911-1 |
| dc.description | The main developments of microfluidic systems for genetic analyses are aimed at the miniaturization of all biological operations from sampling to detection, an operation named by Manz Micro Total Analysis System (μTAS) 20 years ago.1 Since then, intense efforts have been made to integrate on a single device all the steps of sample analysis. This integration proved highly complex and has hindered the development of hands-off systems with sample-in answer-out capabilities, apart from a handful of examples in the literature and only one commercially available device (Cepheid).2â 4Nevertheless, these efforts have not been wasted since we have witnessed successful uses of microfluidic systems for certain dedicated tasks, either as a preparative step or as a detection mean, with major improvements over conventional molecular biology. Some of these devices have now become part of the standard equipment of biology labs, replacing old technologies.We will review here the state-of-the-art of microfluidic systems for genetic analyses and analyze their ability to reproduce biological operations and even go beyond, by achieving superior performances either in speed, consumption or efficiency, especially in the case of single cell analysis. |
| Формат | application.pdf |
| Издатель | Royal Society of Chemistry |
| Название | Chapter 13. DNA Analysis in Microfluidic Devices and their Application to Single Cell Analysis |
| Тип | other |
| DOI | 10.1039/9781849732284-00185 |
| Print ISSN | 1757-7136 |
| Журнал | Unravelling Single Cell Genomics |
| Первая страница | 185 |
| Последняя страница | 195 |
| Библиографическая ссылка | A. Manz, N. Grabera, H. M. Widmera, Sens. Actuators B1, 1990, 244, 248 |
| Библиографическая ссылка | L. C. Waters, S. C. Jacobson, N. Kroutchinina, J. Khandurina, R. S. Foote, J. M. Ramsey, Anal. Chem., 1998, 70, 158, 162 |
| Библиографическая ссылка | R. H. Liu, J. N. Yang, R. Lenigk, J. Bonanno, P. Grodzinski, Anal. Chem., 2004, 76, 1824, 1831 |
| Библиографическая ссылка | C. J. Easley, J. M. Karlinsey, J. M. Bienvenue, L. A. Legendre, M. G. Roper, S. H. Feldman, M. A. Hughes, E. L. Hewlett, T. J. Merkel, J. P. Ferrance, J. P. Landers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 2006, 103, 19272, 19277 |
| Библиографическая ссылка | C. Zhang, J. Xu, W. Ma, W. Zheng, Biotechnol. Adv., 2006, 24, 243, 284 |
| Библиографическая ссылка | P. A. Auroux, Y. Koc, A. deMello, A. Manz, P. J. Day, Lab Chip, 2004, 4, 534, 546 |
| Библиографическая ссылка | C. Zhang, D. Xing, Nucleic Acids Res., 2007, 35, 4223, 4237 |
| Библиографическая ссылка | E. T. Lagally, I. Medintz, R. A. Mathies, Anal. Chem., 2001, 73, 565, 570 |
| Библиографическая ссылка | N. C. Cady, S. Stelick, M. V. Kunnavakkam, C. A. Batt, Sens. Actuators B-Chem., 2005, 107, 332, 341 |
| Библиографическая ссылка | M. G. Roper, C. J. Easley, L. A. Legendre, J. A. Humphrey, J. P. Landers, Anal. Chem., 2007, 79, 1294, 1300 |
| Библиографическая ссылка | M. U. Kopp, A. J. de Mello, A. Manz, Science, 1998, 280, 1046, 1048 |
| Библиографическая ссылка | J. Liu, M. Enzelberger, S. Quake, Electrophoresis, 2002, 23, 1531, 1536 |
| Библиографическая ссылка | L. Chen, J. West, P. A. Auroux, A. Manz, P. J. Day, Anal. Chem., 2007, 79, 9185, 9190 |
| Библиографическая ссылка | T. Thorsen, R. W. Roberts, F. H. Arnold, S. R. Quake, Phys. Rev. Lett., 2001, 86, 4163, 4166 |
| Библиографическая ссылка | D. R. Link, S. L. Anna, D. A. Weitz, H. A. Stone, Phys. Rev. Lett., 2004, 92, 054503 |
| Библиографическая ссылка | D. R. Link, E. Grasland-Mongrain, A. Duri, F. Sarrazin, Z. Cheng, G. Cristobal, M. Marquez, D. A. Weitz, Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 2006, 45, 2556, 2560 |
| Библиографическая ссылка | H. Song, R. F. Ismagilov, J. Am. Chem. Soc., 2003, 125, 14613, 14619 |
| Библиографическая ссылка | M. Chabert, K. D. Dorfman, P. de Cremoux, J. Roeraade, J. L. Viovy, Anal. Chem., 2006, 78, 7722, 7728 |
| Библиографическая ссылка | M. M. Kiss, L. Ortoleva-Donnelly, N. R. Beer, J. Warner, C. G. Bailey, B. W. Colston, J. M. Rothberg, D. R. Link, J. H. Leamon, Anal. Chem., 2008, 80, 23, 8975, 8990 |
| Библиографическая ссылка | J. C. Guatelli, K. M. Whitfield, D. Y. Kwoh, K. J. Barringer, D. D. Richman, T. R. Gingeras, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 1990, 87, 7797 |
| Библиографическая ссылка | J. Compton, Nature, 1991, 350, 91, 92 |
| Библиографическая ссылка | T. Notomi, H. Okayama, H. Masubuchi, T. Yonekawa, K. Watanabe, N. Amino, T. Hase, Nucleic Acids Res., 2000, 28, E63 |
| Библиографическая ссылка | G. T. Walker, M. S. Fraiser, J. L. Schram, M. C. Little, J. G. Nadeau, D. P. Malinowski, Nucleic Acids Res., 1992, 20, 1691, 1696 |
| Библиографическая ссылка | F. B. Dean, S. Hosono, L. Fang, X. Wu, A. F. Faruqi, P. Bray-Ward, Z. Sun, Q. Zong, Y. Du, J. Du, M. Driscoll, W. Song, S. F. Kingsmore, M. Egholm, R. S. Lasken, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2002, 99, 5261, 5266 |
| Библиографическая ссылка | M. Vincent, Y. Xu, H. Kong, EMBO Rep., 2004, 5, 795, 800 |
| Библиографическая ссылка | A. Gulliksen, L. Solli, F. Karlsen, H. Rogne, E. Hovig, T. Nordstrom, R. Sirevag, Anal. Chem., 2004, 76, 9, 14 |
| Библиографическая ссылка | A. Gulliksen, L. A. Solli, K. S. Drese, O. Sorensen, F. Karlsen, H. Rogne, E. Hovig, R. Sirevag, Lab Chip, 2005, 5, 416, 420 |
| Библиографическая ссылка | S. Y. Lee, C. N. Lee, H. Mark, D. R. Meldrum, C. W. Lin, Sens. Actuators B-Chem., 2007, 127, 598, 605 |
| Библиографическая ссылка | Y. Marcy, T. Ishoey, R. S. Lasken, T. B. Stockwell, B. P. Walenz, A. L. Halpern, K. Y. Beeson, S. M. Goldberg, S. R. Quake, PLoS Genet., 2007, 3, 1702, 1708 |
| Библиографическая ссылка | Y. Marcy, C. Ouverney, E. M. Bik, T. Losekann, N. Ivanova, H. G. Martin, E. Szeto, D. Platt, P. Hugenholtz, D. A. Relman, S. R. Quake, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2007, 104, 11889, 11894 |
| Библиографическая ссылка | A. T. Woolley, D. Hadley, P. Landre, A. J. deMello, R. A. Mathies, M. A. Northrup, Anal. Chem., 1996, 68, 4081, 4086 |
| Библиографическая ссылка | M. Hashimoto, F. Barany, S. A. Soper, Biosens. Bioelectron., 2006, 21, 1915, 1923 |
| Библиографическая ссылка | J. G. Lee, K. H. Cheong, N. Huh, S. Kim, J. W. Choi, C. Ko, Lab Chip, 2006, 6, 886, 895 |
| Библиографическая ссылка | B. C. Giordano, J. Ferrance, S. Swedberg, A. F. Huhmer, J. P. Landers, Anal. Biochem., 2001, 291, 124, 132 |
| Библиографическая ссылка | N. R. Beer, B. J. Hindson, E. K. Wheeler, S. B. Hall, K. A. Rose, I. M. Kennedy, B. W. Colston, Anal. Chem., 2007, 79, 8471, 8475 |
| Библиографическая ссылка | R. Dettloff, E. Yang, A. Rulison, A. Chow, J. Farinas, Anal. Chem., 2008, 80, 4208, 4213 |
| Библиографическая ссылка | Y. Schaerli, R. C. Wootton, T. Robinson, V. Stein, C. Dunsby, M. A. Neil, P. M. French, A. J. Demello, C. Abell, F. Hollfelder, Anal. Chem., 2009, 81, 302, 306 |
| Библиографическая ссылка | S. L. Spurgeon, R. C. Jones, R. Ramakrishnan, PLoS One, 2008, 3, e1662 |
| Библиографическая ссылка | P. C. Simpson, D. Roach, A. T. Woolley, T. Thorsen, R. Johnston, G. F. Sensabaugh, R. A. Mathies, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 1998, 95, 2256, 2261 |
| Библиографическая ссылка | E. A. Ottesen, J. W. Hong, S. R. Quake, J. R. Leadbetter, Science, 2006, 314, 1464, 1467 |
| Библиографическая ссылка | T. Thorsen, S. J. Maerkl, S. R. Quake, Science, 2002, 298, 580, 584 |
| Библиографическая ссылка | E. T. Lagally, J. R. Scherer, R. G. Blazej, N. M. Toriello, B. A. Diep, M. Ramchandani, G. F. Sensabaugh, L. W. Riley, R. A. Mathies, Anal. Chem., 2004, 76, 3162, 3170 |
