Автор |
Leeson, Paul D. |
Автор |
Oprea, Tudor I. |
Дата выпуска |
2012 |
ISBN |
978-1-84973-166-9 |
dc.description |
The physical chemistry profiles of successfully marketed oral drugs, backed up by substantial empirical absorption, distribution, metabolism, excretion and toxicity (AMDET) data, point to the existence of a preferred physicochemical drug-like space. The rule of five (Ro5) is a widely accepted measure of this drug-like space, but current medicinal chemistry is largely operating close to the limits of the Ro5, where ADMET risks appear to be substantially greater than at its centre. This may in part explain the high pipeline attrition experienced in the pharmaceutical industry. The lead-like concept is a viable solution to molecular inflation, since it proposes starting with low physical properties, allowing compound optimization to occur within optimal drug-like space. Fragment based drug discovery is a highly promising application of lead-like thinking. The application of ligand efficiency measures, especially lipophilicity ligand efficiency, is a means of keeping physical properties under control in lead generation and optimization programs. |
Формат |
application.pdf |
Издатель |
Royal Society of Chemistry |
Название |
Chapter 2. Drug-Like Physicochemical Properties |
Тип |
other |
DOI |
10.1039/9781849733410-00035 |
Print ISSN |
2041-3203 |
Журнал |
Drug Design Strategies: Quantitative Approaches |
Первая страница |
35 |
Последняя страница |
59 |
Аффилиация |
Leeson Paul D.; AstraZeneca R&D Charnwood |
Аффилиация |
Oprea Tudor I.; Division of Biocomputing |
Библиографическая ссылка |
P. D. Leeson, J. R. Empfield, Annu. Rep. Med. Chem., 2010, 45, 393 |
Библиографическая ссылка |
S. W. Muchmore, J. J. Edmunds, K. D. Stewart, P. J. Hajduk, J. Med. Chem., 2010, 53, 4830 |
Библиографическая ссылка |
G. F. Smith, Prog. Med. Chem., 2009, 48, 1 |
Библиографическая ссылка |
P. D. Leeson, B. Springthorpe, Nat. Rev. Drug Discovery, 2007, 6, 881 |
Библиографическая ссылка |
A. H. Lipkus, Q. Yuan, K. A. Lucas, S. A. Funk, W. F. Bartelt III, R. J. Schenck, A. J. Trippe, J. Org. Chem., 2008, 73, 4443 |
Библиографическая ссылка |
M. S. Lajiness, G. M. Maggiora, V. Shanmugasundaram, J. Med. Chem., 2004, 47, 4891 |
Библиографическая ссылка |
P. D. Leeson, A. M. Davis, J. Steele, Drug Discovery Today: Technol., 2004, 1, 189 |
Библиографическая ссылка |
C. A. Lipinski, F. Lombardo, B. W. Dominy, P. J. Feeney, Adv. Drug Delivery Rev., 1997, 23, 3 |
Библиографическая ссылка |
P. D. Dobson, D. B. Kell, Nat. Rev. Drug Discovery, 2008, 7, 205 |
Библиографическая ссылка |
M. M. Olah, C. G. Bologa, T. I. Oprea, Curr. Drug Discov. Technol., 2004, 1, 211 |
Библиографическая ссылка |
T. I. Oprea, J. Comput.-Aided Mol. Des., 2000, 14, 251 |
Библиографическая ссылка |
P. Ertl, J. Chem. Inf. Comput. Sci., 2003, 43, 374 |
Библиографическая ссылка |
L. C. Blum, J.-L. Reymond, J. Am. Chem. Soc., 2009, 131, 8732 |
Библиографическая ссылка |
O. Ursu, T. I. Oprea, J. Chem. Inf. Model., 2010, 50, 1387 |
Библиографическая ссылка |
M. C. Wenlock, R. P. Austin, P. Barton, A. M. Davis, P. D. Leeson, J. Med. Chem., 2003, 46, 1250 |
Библиографическая ссылка |
M. Vieth, M. G. Siegel, R. E. Higgs, I. A. Watson, D. H. Robertson, K. A. Savin, G. L. Durst, P. A. Hipskind, J. Med Chem., 2004, 47, 224 |
Библиографическая ссылка |
J. R. Proudfoot, Bioorg. Med. Chem. Lett., 2005, 15, 1087 |
Библиографическая ссылка |
T. J. Ritchie, C. N. Luscombe, J. F. Macdonald, J. Chem. Inf. Model., 2009, 49, 1025 |
Библиографическая ссылка |
P. D. Leeson, A. M. Davis, J. Med. Chem., 2004, 47, 6338 |
Библиографическая ссылка |
C. Lamanna, M. Bellini, A. Padova, G. Westerberg, L. Maccari, J. Med. Chem., 2008, 51, 2891 |
Библиографическая ссылка |
F. Lovering, J. Bikker, C. Humblet, J. Med. Chem., 2009, 52, 6752 |
Библиографическая ссылка |
T. J. Ritchie, S. J. F. MacDonald, Drug Discovery Today, 2009, 14, 1011 |
Библиографическая ссылка |
A. P. Hill, R. J. Young, Drug Discovery Today, 2010, 15, 648 |
Библиографическая ссылка |
D. A. Smith, L. Di, E. H. Kerns, Nat. Rev. Drug Discovery, 2010, 9, 929 |
Библиографическая ссылка |
D. Kong, W. Ren, W. Lu, H. Zhang, J. Chem. Inf. Model., 2009, 49, 2376 |
Библиографическая ссылка |
P. D. Dobson, Y. Patel, D. B. Kell, Drug Discovery Today, 2009, 14, 31 |
Библиографическая ссылка |
H. Kubinyi, Nat. Rev. Drug Discovery, 2003, 2, 665 |
Библиографическая ссылка |
T. I. Oprea, J. Comp.-Aided Mol. Des., 2002, 16, 325 |
Библиографическая ссылка |
J. Kelder, P. D. Grootenhuis, D. M. Bayada, L. P. Delbressine, J. P. Ploemen, Pharm. Res., 1999, 16, 1514 |
Библиографическая ссылка |
M. P. Gleeson, J. Med. Chem., 2008, 51, 817 |
Библиографическая ссылка |
T. W. Johnson, K. R. Dress, M. Edwards, Bioorg. Med. Chem. Lett., 2009, 19, 5560 |
Библиографическая ссылка |
M. J. Waring, Bioorg. Med. Chem. Lett., 2009, 19, 2844 |
Библиографическая ссылка |
H. van de Waterbeemd, Chem. Biodivers., 2009, 6, 1760 |
Библиографическая ссылка |
M. L. Lewis, L. Cucurull-Sanchez, J. Comp.-Aided Mol. Des., 2009, 23, 97 |
Библиографическая ссылка |
A. G. Dossetter, Bioorg. Med. Chem., 2010, 18, 4405 |
Библиографическая ссылка |
P. Gleeson, G. Bravi, S. Modi, D. Lowe, Bioorg. Med. Chem., 2009, 17, 5906 |
Библиографическая ссылка |
J. G. Topliss, J. Med. Chem., 1972, 15, 1006 |
Библиографическая ссылка |
L. Z. Benet, C. L. Cummins, C. Y. Wu, Int. J. Pharm., 2004, 277, 3 |
Библиографическая ссылка |
J. M. Custodio, C. Y. Wu, L. Z. Benet, Adv. Drug Delivery Rev., 2008, 60, 717 |
Библиографическая ссылка |
M. V. S. Varma, R. S. Obach, C. Rotter, H. R. Miller, G. Chang, S. J. Steyn, A. El-Kattan, M. D. Troutman, J. Med. Chem., 2010, 53, 1098 |
Библиографическая ссылка |
D. F. Veber, S. R. Johnson, H. Cheng, B. R. Smith, K. W. Ward, K. D. Kopple, J. Med. Chem., 2002, 45, 2615 |
Библиографическая ссылка |
Y. C. Martin, J. Med. Chem., 2005, 48, 3164 |
Библиографическая ссылка |
J. J. Lu, K. Crimin, J. T. Goodwin, P. Crivori, C. Orrenius, L. Xing, P. J. Tandler, T. J. Vidmar, B. M. Amore, A. G. E. Wilson, P. F. W. Stouten, P. S. Burton, J. Med. Chem., 2004, 47, 6104 |
Библиографическая ссылка |
T. Hou, J. Wang, W. Zhang, X. Xu, J. Chem. Inf. Model., 2007, 47, 208 |
Библиографическая ссылка |
D. E. Clark, J. Pharm. Sci., 1999, 88, 815 |
Библиографическая ссылка |
H. Pajouhesh, G. R. Lenz, J. Am. Soc. Exper. Neuro. Ther., 2005, 2, 541 |
Библиографическая ссылка |
S. A. Hitchcock, L. D. Pennington, J. Med. Chem., 2006, 49, 1 |
Библиографическая ссылка |
T. T. Wager, R. Y. Chandrasekaran, X. Hou, M. D. Troutman, P. R. Verhoest, A. Villalobos, Y. Will, ACS Chem. Neurosci., 2010, 1, 420 |
Библиографическая ссылка |
T. T. Wager, X. Hou, P. R. Verhoest, A. Villalobos, ACS Chem. Neurosci., 2010, 1, 435 |
Библиографическая ссылка |
R. O'Shea, E. H. Moser, J. Med. Chem., 2008, 51, 2871 |
Библиографическая ссылка |
A. S. Kalgutkar, M. T. Didiuk, Chem. Biodivers., 2009, 6, 2115 |
Библиографическая ссылка |
S. J. Enoch, M. T. D. Cronin, Crit. Rev. Toxicol., 2010, 40, 728 |
Библиографическая ссылка |
A. S. Kalgutkar, G. Fate, M. T. Didiuk, J. Bauman, Expert Rev. Clin. Pharmacol., 2008, 1, 515 |
Библиографическая ссылка |
A. S. Kalgutkar, I. Gardner, R. S. Obach, C. L. Shaffer, E. Callegari, K. R. Henne, A. E. Mutlib, D. K. Dalvie, J. S. Lee, Y. Nakai, J. P. O'Donnell, J. Boer, S. P. Harriman, Curr. Drug Metabol., 2005, 6, 161 |
Библиографическая ссылка |
S. Kumar, T. A. Baillie, Drugs Pharm. Sci., 2009, 186, 597 |
Библиографическая ссылка |
R. K. Elespuru, R. Agarwal, A. H. Atrakchi, C. A. H. Bigger, R. H. Heflich, J. R. Jagannath, D. D. Levy, M. M. Moore, Y. Ouyang, T. W. Robison, R. E. Sotomayor, M. C. Cimino, K. L Dearfield, Toxicol. Sci., 2009, 109, 172 |
Библиографическая ссылка |
S. P. Raillard, J. Bercu, S. W. Baertschi, C. M. Riley, Org. Process Res. Dev., 2010, 14, 1015 |
Библиографическая ссылка |
D. A. Price, J. Blagg, L. Jones, N. Greene, T. Wager, Expert Opin. Drug Metab. Toxicol., 2009, 5, 921 |
Библиографическая ссылка |
E. J. Matthews, C. J. Ursem, N. L. Kruhlak, R. D. Benz, D. Aragonés Sabaté, C. Yang, G. Klopman, J. F. Contrera, Regul. Toxicol. Pharm., 2009, 54, 23 |
Библиографическая ссылка |
E. J. Matthews, N. L. Kruhlak, R. D. Benz, R. D. A. Sabate, C. A. Marchant, J. F. Contrera, Regul. Toxicol. Pharm., 2009, 54, 43 |
Библиографическая ссылка |
A. L. Hopkins, Nat. Chem. Biol., 2008, 4, 682 |
Библиографическая ссылка |
M. J. Keiser, V. Setola, J. J. Irwin, C. Laggner, A. I. Abbas, S. J. Hufeisen, N. H. Jensen, M. B. Kuijer, R. C. Matos, T. B. Tran, R. Whaley, R. A. Glennon, J. Hert, K. L. H. Thomas, D. D. Edwards, B. K. Shoichet, B. L. Roth, Nature, 2009, 462, 175 |
Библиографическая ссылка |
E. E. Schadt, S. H. Friend, D. A. Shaywitz, Nat. Rev. Drug Discovery, 2009, 8, 286 |
Библиографическая ссылка |
T. I. Oprea, A. Tropsha, J. L. Faulon, M. D. Rintoul, Nat. Chem. Biol., 2007, 3, 447 |
Библиографическая ссылка |
L. Roth, D. J. Sheffler, W. K. Kroeze, Nat. Rev. Drug Discovery, 2004, 3, 353 |
Библиографическая ссылка |
R. Morphy, J. Med. Chem., 2010, 53, 1413 |
Библиографическая ссылка |
F. Milletti, A. Vulpetti, J. Chem. Inf. Model., 2010, 50, 1418 |
Библиографическая ссылка |
Z. A. Knight, H. Lin, K. M. Shokat, Nat. Rev. Cancer, 2010, 10, 130 |
Библиографическая ссылка |
F. Broccatelli, E. Carosati, G. Cruciani, T. I. Opera, Mol. Inf., 2010, 29, 16 |
Библиографическая ссылка |
R. Morphy, Z. Rankovic, J. Med. Chem., 2006, 49, 4961 |
Библиографическая ссылка |
C. Melchiorre, M. L. Bolognesi, A. Minarini, M. Rosini, V. Tumiatti, J. Med. Chem., 2010, 53, 5906 |
Библиографическая ссылка |
J. B. Baell, G. A. Holloway, J. Med. Chem., 2010, 53, 2719 |
Библиографическая ссылка |
M. L. Radhakrishnan, B. Tidor, J. Phys. Chem. B, 2007, 111, 13419 |
Библиографическая ссылка |
A. L. Hopkins, J. S. Mason, J. P. Overington, Curr. Opin. Struct. Biol., 2006, 16, 127 |
Библиографическая ссылка |
J. Peters, P. Schnider, P. Mattei, M. Kansy, ChemMedChem, 2009, 4, 680 |
Библиографическая ссылка |
E. Gregori-Puigjane, J. Mestres, Comb. Chem. High Throughput Screening, 2008, 11, 669 |
Библиографическая ссылка |
K. Azzaoui, J. Hamon, B. Faller, S. Whitebread, E. Jacoby, A. Bender, J. L. Jenkins, L. Urban, ChemMedChem, 2007, 2, 874 |
Библиографическая ссылка |
Y. Yang, H. Chen, I. Nilsson, S. Muresan, O. Engkvist, J. Med. Chem., 2010, 53, 7709 |
Библиографическая ссылка |
D. J. Diller, Curr. Comput.-Aided Drug Des., 2009, 5, 106 |
Библиографическая ссылка |
A. Stary, S. J. Wacker, L. Boukharta, U. Zachariae, Y. Karimi-Nejad, J. Aqvist, G. Vriend, B. L. de Groot, ChemMedChem, 2010, 5, 455 |
Библиографическая ссылка |
G. Gintant, Pharmacology & Therapeutics, 2011, 129, 109 |
Библиографическая ссылка |
A. J. Ratcliffe, Current Medicinal Chemistry, 2009, 16, 2816 |
Библиографическая ссылка |
M. T. D. Cronin, Curr. Comput.-Aided Drug Des., 2006, 2, 405 |
Библиографическая ссылка |
J. D. Hughes, J. Blagg, D. A. Price, S. Bailey, G. A. DeCrescenzo, R. V. Devraj, E. Ellsworth, Y. M. Fobian, M. E. Gibbs, R. W. Gilles, N. Greene, E. Huang, T. Krieger-Burke, J. Loesel, T. Wager, L. Whiteley, Y. Zhang, Bioorg. Med. Chem. Lett., 2008, 18, 4872 |
Библиографическая ссылка |
J. Uetrecht, Curr. Opin. Drug. Discovery Dev., 2001, 4, 55 |
Библиографическая ссылка |
N. Greene, M. D. Aleo, S. Louise-May, D. A. Price, Y. Will, Bioorg. Med. Chem. Lett., 2010, 20, 5308 |
Библиографическая ссылка |
A. L. Hopkins, C. R. Groom, Nat. Rev. Drug Discovery, 2002, 1, 727 |
Библиографическая ссылка |
K. Beaumont, E. Schmid, D. A. Smith, Bioorg. Med. Chem. Lett., 2005, 15, 3658 |
Библиографическая ссылка |
D. E. Grigoriadis, S. R. J. Hoare, S. M. Lechner, D. H. Slee, J. A. Williams, Neuropsychopharmacology, 2009, 34, 106 |
Библиографическая ссылка |
M. Vieth, J. J. Sutherland, J. Med. Chem., 2006, 49, 3451 |
Библиографическая ссылка |
R. Morphy, J. Med. Chem., 2006, 49, 2969 |
Библиографическая ссылка |
A. C. Cheng, R. G. Coleman, K. T. Smyth, Q. Cao, P. Soulard, D. R. Caffrey, A. C. Salzberg, E. S. Huang, Nat. Biotechnol., 2007, 25, 71 |
Библиографическая ссылка |
P. Schmidtke, X. Barril, J. Med. Chem., 2010, 53, 5858 |
Библиографическая ссылка |
J. Seco, F. J. Luque, X. Barril, J. Med. Chem., 2009, 52, 2363 |
Библиографическая ссылка |
S. J. Teague, Nat. Rev. Drug Discovery, 2003, 2, 527 |
Библиографическая ссылка |
S. J. Teague, A. M. Davis, P. D. Leeson, T. Oprea, Angew. Chem. Int. Ed., 1999, 38, 3743 |
Библиографическая ссылка |
M. M. Hann, A. R. Leach, G. Harper, J. Chem. Inf. Comput. Sci., 2001, 41, 856 |
Библиографическая ссылка |
T. I. Oprea, A. M. Davis, S. J. Teague, P. D. Leeson, J. Chem. Inf. Comput. Sci., 2001, 41, 1308 |
Библиографическая ссылка |
J. R. Proudfoot, Bioorg. Med. Chem. Lett., 2002, 12, 1647 |
Библиографическая ссылка |
T. I. Oprea, T. K. Allu, D. C. Fara, R. F. Rad, L. Ostopovici, C. G. Bologa, J. Comp.-Aided. Mol. Des., 2007, 21, 113 |
Библиографическая ссылка |
C. Tyrchan, N. Blomberg, O. Engkvist, T. Kogej, S. Muresan, Bioorg. Med. Chem. Lett., 2009, 19, 6943 |
Библиографическая ссылка |
G. M. Keseru, G. M. Makara, Nat. Rev. Drug Discovery, 2009, 8, 203 |
Библиографическая ссылка |
E. Perola, J. Med. Chem., 2010, 53, 2986 |
Библиографическая ссылка |
G. M. Rishton, Curr. Opinion Chem. Biol., 2008, 12, 340 |
Библиографическая ссылка |
W. F. Michne, Pharmaceut. News, 1996, 3, 19 |
Библиографическая ссылка |
C. J. Manly, J. Chandrasekhar, J. W. Ochterski, J. D. Hammer, B. B. Warfield, Drug Discovery Today, 2008, 13, 99 |
Библиографическая ссылка |
R. A. Goodnow Jr, P. Gillespie, Prog, Med. Chem., 2007, 45, 1 |
Библиографическая ссылка |
A. Steinmeyer, ChemMedChem, 2006, 1, 31 |
Библиографическая ссылка |
A. M. Davis, D. J. Keeling, J. Steele, N. P. Tomkinson, A. C Tinker, Curr. Top. Med. Chem., 2005, 5, 421 |
Библиографическая ссылка |
M. Congreve, R. Carr, C. Murray, H. Jhoti, Drug Discovery Today, 2003, 8, 876 |
Библиографическая ссылка |
M. Congreve, G. Chessari, D. Tisi, A. J. Woodhead, J. Med. Chem., 2008, 51, 3661 |
Библиографическая ссылка |
A. L. Gill, M. Verdonk, R. G. Boyle, R. Taylor, Curr. Top. Med. Chem., 2007, 7, 1408 |
Библиографическая ссылка |
A. L. Hopkins, C. R. Groom, A. Alex, Drug Discovery Today, 2004, 9, 430 |
Библиографическая ссылка |
P. R. Andrews, D. J. Craik, J. L. Martin, J. Med. Chem., 1984, 27, 1648 |
Библиографическая ссылка |
I. D. Kuntz, K. Chen, K. A. Sharp, P. A. Kollman, Proc. Nat. Acad. Sci., U.S.A., 1999, 96, 9997 |
Библиографическая ссылка |
C. Abad-Zapatero, Expert Opin. Drug Discovery, 2007, 2, 469 |
Библиографическая ссылка |
M. L Verdonk, D. C. Rees, ChemMedChem., 2008, 3, 1179 |
Библиографическая ссылка |
J. Mestres, E. Gregori-Puigjane, Trends Pharmacol. Sci., 2009, 30, 470 |
Библиографическая ссылка |
A. R. Leach, M. M. Hann, J. N. Burrows, E. J. Griffen, Mol. BioSyst., 2006, 2, 429 |
Библиографическая ссылка |
C. H. Reynolds, B. A. Tounge, S. D. Bembenek, J. Med. Chem., 2008, 51, 2432 |
Библиографическая ссылка |
J. W. M. Nissink, J. Chem. Inf. Model., 2009, 49, 1617 |
Библиографическая ссылка |
S. D. Bembenek, B. A. Tounge, C. H. Reynolds, Drug Discovery Today, 2009, 14, 278 |
Библиографическая ссылка |
D. C. Rees, M. Congreve, C. W. Murray, R. Carr, Nat. Rev. Drug Discovery, 2004, 3, 660 |
Библиографическая ссылка |
J. S. Albert, N. Blomberg, A. L. Breeze, A. J. H. Brown, J. N. Burrows, P. D. Edwards, R. H. Folmer, S. Geschwindner, E. J. Griffen, P. W. Kenny, T. Nowak, L.-L. Olsson, H. Sanganee, A. B. Shapiro, Curr. Top. Med. Chem., 2007, 7, 1600 |
Библиографическая ссылка |
A. B. Reitz, G. R. Smith, B. A. Tounge, C. H. Reynolds, Curr. Top. Med. Chem., 2009, 9, 1718 |
Библиографическая ссылка |
C. A. Lipinski, J. Pharmacol. Toxicol. Methods, 2001, 44, 235 |
Библиографическая ссылка |
I. Shamovsky, S. Connolly, L. David, S. Ivanova, B. Norden, B. Springthorpe, K. Urbahns, J. Med. Chem., 2008, 51, 1162 |
Библиографическая ссылка |
T. Ryckmans, M. P. Edwards, V. A. Horne, A. M. Correia, D. R. Owen, L. R. Thompson, I. Tran, M. F. Tutt, T. Young, Bioorg. Med. Chem. Lett., 2009, 19, 4406 |
Библиографическая ссылка |
K. N. Dack, S. Skerratt, P. S. Johnson, P. A. Bradley, I. R, Marsh, Bioorg. Med. Chem. Lett., 2010, 20, 3384 |
Библиографическая ссылка |
C. E. Mowbray, R. Corbau, M. Hawes, L. H. Jones, J. E. Mills, M. Perros, M. D. Selby, P. A. Stupple, R. Webster, A. Wood, Bioorg. Med. Chem. Lett., 2009, 19, 5603 |
Библиографическая ссылка |
I. Shamovsky, C. de Graaf, L. Alderin, M. Bengtsson, H. Bladh, L. Borjesson, S. Connolly, H. J. Dyke, M. van den Heuvel, H. Johansson, B.-G. Josefsson, A. Kristoffersson, T. Linnanen, A. Lisius, R. Mannikko, B. Norden, S. Price, L. Ripa, D. Rognan, A. Rosendahl, M. Skrinjar, K. Urbahns, J. Med. Chem., 2009, 52, 7706 |
Библиографическая ссылка |
M. P. Edwards, D. A. Price, Annu. Rep. Med. Chem., 2010, 45, 381 |
Библиографическая ссылка |
I. Kola, J. Landis, Nat. Rev. Drug Discovery, 2004, 3, 711 |
Библиографическая ссылка |
B. Munos, Nat. Rev. Drug Discovery, 2009, 8, 959 |
Библиографическая ссылка |
S. M. Paul, D. S. Mytelka, C. T. Dunwiddie, C. C. Persinger, B. H. Munos, S. R. Lindborg, A. L. Schacht, Nat. Rev. Drug Discovery, 2010, 9, 203 |