Автор |
Zhou, Chuanzheng |
Автор |
Honcharenko, Dmytro |
Автор |
Chattopadhyaya, Jyoti |
Дата выпуска |
2007 |
dc.description |
The 2-(4-tolylsulfonyl)ethoxymethyl (TEM) as a new 2â ²-OH protecting group is reported for solid-supported RNA synthesis using phosphoramidite chemistry. The usefulness of the 2â ²-O-TEM group is exemplified by the synthesis of 12 different oligo-RNAs of various sizes (14â 38 nucleotides long). The stepwise coupling yield varied from 97â 99% with an optimized coupling time of 120 s. The synthesis of all four pure phosphoramidite building blocks is also described. Two new reliable parameters, δC2â ² â δC3â ² and δH2â ² â δH3â ², have been suggested for the characterization of isomeric 2â ²-O-TEM and 3â ²-O-TEM as well as other isomeric mono 2â ²/3â ²-protected ribonucleoside derivatives. The most striking feature of this strategy is that the crude RNA prepared using our 2â ²-O-TEM strategy is sufficiently pure (>90%) for molecular biology research without any additional purification step, thereby making oligo-RNAs easily available at a relatively low cost, saving both time and lab resources. |
Формат |
application.pdf |
Издатель |
Royal Society of Chemistry |
Название |
2-(4-Tolylsulfonyl)ethoxymethyl (TEM)—a new 2′-OH protecting group for solid-supported RNA synthesis |
Тип |
research-article |
DOI |
10.1039/b614210a |
Electronic ISSN |
1477-0539 |
Print ISSN |
1477-0520 |
Журнал |
Organic & Biomolecular Chemistry |
Том |
5 |
Первая страница |
333 |
Последняя страница |
343 |
Аффилиация |
Zhou Chuanzheng; Department of Bioorganic Chemistry, Box 581, Biomedical Center, Uppsala University |
Аффилиация |
Honcharenko Dmytro; Department of Bioorganic Chemistry, Box 581, Biomedical Center, Uppsala University |
Аффилиация |
Chattopadhyaya Jyoti; Department of Bioorganic Chemistry, Box 581, Biomedical Center, Uppsala University |
Выпуск |
2 |
Библиографическая ссылка |
Fire, Nature, 1998, 391, 808 |
Библиографическая ссылка |
Elbashir, Nature, 2001, 411, 494 |
Библиографическая ссылка |
Reese, Org. Biomol. Chem., 2005, 3, 3851 |
Библиографическая ссылка |
Gasparutto, Nucleosides Nucleotides, 1990, 9, 1087 |
Библиографическая ссылка |
C. B.Reese, ‘Protection of 2′-hydroxy functions of ribonucleosides’ in Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry, ed. S. L. Beaucage, D. E. Bergstrom, G. D. Glick and R. A. Jones, John Wiley & Sons, New York, 2000 |
Библиографическая ссылка |
Chaulk, Nucleic Acids Res., 1998, 26, 3173 |
Библиографическая ссылка |
Schwartz, Bioorg. Med. Chem. Lett., 1992, 2, 1019 |
Библиографическая ссылка |
Reese, J. Am. Chem. Soc., 1967, 89, 3366 |
Библиографическая ссылка |
Sandstroem, Acta Chem. Scand., Ser. B, 1985, 39, 273 |
Библиографическая ссылка |
Sandstroem, Nucleosides Nucleotides, 1985, 4, 177 |
Библиографическая ссылка |
Lloyd, J. Chem. Soc., Perkin Trans. 1, 2000, 165 |
Библиографическая ссылка |
Pfister, Helv. Chim. Acta, 1995, 78, 1705 |
Библиографическая ссылка |
Matysiak, Helv. Chim. Acta, 2001, 84, 1066 |
Библиографическая ссылка |
Semenyuk, J. Am. Chem. Soc., 2006, 128, 12356 |
Библиографическая ссылка |
Ogilvie, Tetrahedron Lett., 1974, 33, 2861 |
Библиографическая ссылка |
Ogilvie, J. Am. Chem. Soc., 1977, 99, 7741 |
Библиографическая ссылка |
Usman, J. Am. Chem. Soc., 1987, 109, 7845 |
Библиографическая ссылка |
Wada, Tetrahedron Lett., 1995, 36, 1683 |
Библиографическая ссылка |
Umemoto, Tetrahedron Lett., 2004, 45, 9529 |
Библиографическая ссылка |
Rao, J. Chem. Soc., Perkin Trans. 1, 1993, 43 |
Библиографическая ссылка |
Stawinski, Nucleic Acids Res., 1988, 16, 9285 |
Библиографическая ссылка |
Wu, Nucleic Acids Res., 1989, 17, 3501 |
Библиографическая ссылка |
Jones, J. Chem. Soc., Perkin Trans. 1, 1979, 2762 |
Библиографическая ссылка |
Scaringe, Nucleic Acids Res., 1990, 18, 5433 |
Библиографическая ссылка |
Scaringe, J. Am. Chem. Soc., 1998, 120, 11820 |
Библиографическая ссылка |
Pitsch, Helv. Chim. Acta, 2001, 84, 3773 |
Библиографическая ссылка |
Ohgi, Org. Lett., 2005, 7, 3477 |
Библиографическая ссылка |
Bordwell, Acc. Chem. Res., 1988, 21, 456 |
Библиографическая ссылка |
Josephson, Tetrahedron Lett., 1981, 22, 4537 |
Библиографическая ссылка |
Jain, J. Med. Chem., 2004, 47, 3843 |
Библиографическая ссылка |
Watanabe, Angew. Chem., Int. Ed. Engl., 1966, 5, 579 |
Библиографическая ссылка |
Sheppard, J. Org. Chem., 1994, 59, 7243 |
Библиографическая ссылка |
Chaix, Nucleic Acids Res., 1989, 17, 7381 |
Библиографическая ссылка |
McBride, Tetrahedron Lett., 1983, 24, 245 |
Библиографическая ссылка |
Fromageot, Tetrahedron, 1966, 22, 705 |
Библиографическая ссылка |
Ogilvie, Can. J. Chem., 1979, 57, 2230 |
Библиографическая ссылка |
Milecki, Tetrahedron Lett., 1999, 55, 6603 |
Библиографическая ссылка |
Pon, Tetrahedron Lett., 1997, 38, 3331 |
Библиографическая ссылка |
Vargeese, Nucleic Acids Res., 1998, 26, 1046 |
Библиографическая ссылка |
Lieber, J. Org. Chem., 1961, 4472 |
Библиографическая ссылка |
Dahl, Nucleic Acids Res., 1987, 15, 1729 |
Библиографическая ссылка |
Umemoto, Tetrahedron Lett., 2005, 46, 4251 |
Библиографическая ссылка |
Pradeepkumar, J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2, 2001, 402 |