| Автор | Atkinson Vladimir Saudek, R. Andrew |
| Автор | Saudek, Vladimir |
| Дата выпуска | 1997 |
| dc.description | The possibility of determining protein structure directly from NMR spectra is investigated. Optimisation of four variables per atom (δ, x, y, z) directly against the nuclear Overhauser effect (NOE) spectrum by simulated annealing is shown to succeed in finding sets of coordinates (i.e. structures) and chemical shifts that match the reference configuration. The procedure is shown to work on both a fully resolved spectrum and when two resonances are overlapping. It is proposed that a direct approach may ultimately replace current methods of structure determination (assignment followed by structure calculation). |
| Формат | application.pdf |
| Издатель | Royal Society of Chemistry |
| Название | Direct fitting of structure and chemical shift to NMR spectra |
| Тип | research-article |
| DOI | 10.1039/a702834b |
| Electronic ISSN | 1364-5455 |
| Print ISSN | 0956-5000 |
| Журнал | Journal of the Chemical Society, Faraday Transactions |
| Том | 93 |
| Первая страница | 3319 |
| Последняя страница | 3323 |
| Выпуск | 18 |
| Библиографическая ссылка | W. P. Aue, E. Bartholdi, R. R. Ernst, J. Chem. Phys., 1976, 64, 2229 |
| Библиографическая ссылка | H. Oschkinat, C. Griesinger, P. J. Kraulis, O. W. Sorensen, R. R. Ernst, A. M. Gronenborn, G. M. Clore, Nature (London), 1988, 332, 374 |
| Библиографическая ссылка | L. Müller, J. Am. Chem. Soc., 1979, 101, 4481 |
| Библиографическая ссылка | G. Bodenhausen, D. J. Ruben, Chem. Phys. Lett., 1980, 69, 185 |
| Библиографическая ссылка | A. Bax, R. H. Griffey, B. L. Hawkins, J. Am. Chem. Soc., 1983, 105, 7188 |
| Библиографическая ссылка | G. M. Clore, A. M. Gronenborn, Methods Enzymol., 1994, 239, 349 |
| Библиографическая ссылка | G. Wagner, S. G. Hyberts, T. F. Havel, Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct., 1992, 21, 167 |
| Библиографическая ссылка | M. Karplus, J. Phys. Chem., 1959, 30, 11 |
| Библиографическая ссылка | A. Pardi, M. Billeter, K. Wüthrich, J. Mol. Biol., 1984, 180, 741 |
| Библиографическая ссылка | T. F. Havel, K. Wüthrich, J. Mol. Biol., 1985, 182, 281 |
| Библиографическая ссылка | W. Braun, N. Go, J. Mol. Biol., 1985, 186, 611 |
| Библиографическая ссылка | A. T. Brünger, G. M. Clore, A. M. Gronenborn, M. Karplus, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1986, 83, 3801 |
| Библиографическая ссылка | M. Nilges, G. M. Clore, A. T. Brünger, A. M. Gronenborn, Protein Eng., 1988, 2, 27 |
| Библиографическая ссылка | T. L. James, Curr. Opin. Struct. Biol., 1994, 4, 275 |
| Библиографическая ссылка | C. Bartels, K. Wüthrich, J. Biomol. NMR, 1994, 4, 775 |
| Библиографическая ссылка | M. S. Friedrichs, L. Müller, M. Wittekind, J. Biomol. NMR, 1994, 4, 703 |
| Библиографическая ссылка | B. J. Hare, J. H. Prestegard, J. Biomol. NMR, 1994, 4, 35 |
| Библиографическая ссылка | R. P. Meadows, E. T. Olejniczak, S. W. Fesik, J. Biomol. NMR, 1994, 4, 79 |
| Библиографическая ссылка | J. B. Olson Jr., J. L. Markley, J. Biomol. NMR, 1994, 4, 385 |
| Библиографическая ссылка | N. Morelle, B. Brutscher, J.-P. Simorre, D. Marion, J. Biomol. NMR, 1995, 5, 154 |
| Библиографическая ссылка | D. A. Case, H. J. Dyson, P. E. Wright, Methods Enzymol., 1994, 239, 392 |
| Библиографическая ссылка | E. Oldfield, J. Biomol. NMR, 1995, 5, 217 |
| Библиографическая ссылка | T. E. Malliavin, A. Rouh, M. A. Delsuc, J.-Y. Lallemand, C. R. Acad. Sci. Paris II, 1992, 315, 653 |
| Библиографическая ссылка | C. M. Oshiro, I. D. Kuntz, Biopolymers, 1993, 33, 107 |
| Библиографическая ссылка | P. J. Kraulis, J. Mol. Biol., 1994, 243, 696 |
| Библиографическая ссылка | C. Mumenthaler, W. Braun, J. Mol. Biol., 1995, 254, 465 |
| Библиографическая ссылка | M. Nilges, J. Mol. Biol., 1995, 245, 645 |
| Библиографическая ссылка | S. Kirkpatrick, C. D. Gelatt Jr., M. P. Vecchi, Science, 1983, 220, 671 |
| Библиографическая ссылка | W. L. Goffe, G. D. Ferrier, J. Rogers, J. Econometrics, 1994, 60, 65 |
| Библиографическая ссылка | A. Wlodawer, J. Nachman, G. L. Gilliland, W. Gallagher, C. Woodward, J. Mol. Biol., 1987, 198, 469 |
| Библиографическая ссылка | N. Metropolis, M. Rosenbluth, A. Rosenbluth, A. Teller, E. Teller, J. Chem. Phys., 1953, 21, 1087 |
| Библиографическая ссылка | P. Yip, D. A. Case, J. Magn. Reson., 1989, 83, 643 |
| Библиографическая ссылка | P. Koehl, J.-F. Lefèvre, J. Magn. Reson., 1990, 86, 565 |
| Библиографическая ссылка | M. Nilges, J. Habazettl, A. T. Brünger, T. A. Holak, J. Mol. Biol., 1991, 219, 499 |
